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Eigenschaften von Strukturdeskriptoren

Die Tabelle faßt die wichtigsten Invarianz-Eigenschaften verschiedener Strukturdeskriptoren zusammen.

Deskriptor
Molekülrepräsentation
Mathematische Repräsentation
Invariante Eigenschaften
Molekulargewicht
0D
Skalar
ncd
Atomtyp Zähler
0D
Skalar
ncd
Fragment-Zähler
1D
Skalar
ncd
Topologische Informationsindices
2D
Skalar
ncd
Molekülprofile
2D
Vektor
ncd
Substituenten-Konstanten
3D
Skalar
ncd/lcd
WHIM Deskriptoren
3D
Vektor
hcd
3D-MoRSE Deskriptoren
3D
Vektor
ncd/icd
Oberfläche/Volumen Deskriptoren
3D
Skalar
hcd/icd
Quanten-chemische Deskriptoren
3D
Skalar
icd/hcd
Wechselwirkungs-Energiewerte
4D
Gitter
hcd

Invariante Eigenschaften verschiedener Deskriptoren (ncd: no conformational dependency = keine Abhängigkeit der Konformation; lcd: low conformational dependency = geringe Abhängigkeit der Konformation; icd: intermediate conformational dependency = mittlere Abhängigkeit der Konformation; hcd - high conformational dependency = hohe Abhängigkeit der Konformation)

Topologische und 3D-Deskriptoren, die im "Distanz-Raum" berechnet wurden, wie z.B. 3D Autokorrelation, Oberflächen-Autokorrelation und RDF sind Translations- und Rotations-Invariant. Trotzdem können alle diese Deskriptoren nicht zur Unterscheidung von Enantiomeren herangezogen werden.
Zur Berechnung Gitter-basierter Deskriptoren müssen in einem ersten Schritt die Liganden angeordnet (aligned) werden. Haben die Moleküle das gleiche Skelett, ist das Alignment unkritisch.


© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. Th. Engel, CCC Univ. Erlangen, Wed Jun 9 12:55:24 2004 GMT
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