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Chemoinformatik
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Beurteilung der Linearnotationen

Vorteile Nachteile
Wiswesser Line Notation
 
  • prägnanter Linearcode
  • einfache Substruktursuche möglich
  • beinhaltet Stereochemie
  • eindeutig
  • eineindeutig wenn Regeln beachtet werden
  • umfangreiche, komplizierte Regeln
  • Aufstellung des Codes ist fehleranfällig
  • schwierig in Connection Table zu überführen
  • nur die Substrukturen die im Code enthalten sind, können in einer Substruktur-Suche direkt wieder gefunden werden
  • Reaktions-Codierung wird nicht unterstützt
ROSDAL
 
  • einfach zu erlernender Code
  • schnelles Austauschformat
  • beinhaltet Stereochemie
  • eindeutig
  • Reaktions-Codierung wird nicht unterstützt
  • nicht eineindeutig
SMILES
 
  • einfachster Linearcode
  • einfach zu erlernen
  • schnelles Austauschformat
  • unterstützt Markush-, Stereochemie- und Reaktionscodierung
  • eindeutig
  • nicht eineindeutig (Ausnahme: Unique SMILES)
  • Probleme mit Aromatenerkennung
SLN
 
  • einfach zu erlernender Code
  • Markush und Makro-Atome können definiert werden
  • beinhaltet Stereochemie
  • schnelles Austauschformat
  • eindeutig
  • nicht eineindeutig
  • Aromatizität muß normalisiert werden
  • keine Valenzregeln
  • Reaktions-Codierung wird nicht unterstützt

© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. Th. Engel, CCC Univ. Erlangen, Thu Dec 18 14:53:53 2003 GMT
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