Methoden der Ähnlichkeitssuche

Fragmentbasierte Ähnlichkeitssuche:

Die Zielverbindung wird zerlegt und anhand vordefinierter Fragmente mit den Katalogverbindungen verglichen. Diese Methode sagt nur aus, ob ein Fragment vorhanden ist oder nicht, wodurch der Wert zu den globalen Ähnlichkeitsmaßen gehört.

Ähnlichkeitssuche über topologische Indices:

Auch hier handelt es sich um globale Ähnlichkeitsmaße. Die Strukturen werden nach Größe, Atomtypen, Konnektivität, Verzweigung, Mehrfachbindungen usw. verglichen. Der Wert wird dann auf einer Skala zwischen 0 und 1 ausgegeben.

3D-Substrukturbasierte Ähnlichkeitssuche:

Dieses Verfahren liefert lokale Ähnlichkeitsmaße. Gemeinsame Strukturteile werden erkannt und überlagert, es kann die größte gemeinsame Substruktur (most common substructure = MCS) gefunden werden. Man erhält ein Distanzmaß; für identische Moleküle ist der Wert 0.

© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. A. Schunk, Dr. Th. Engel, CCC Univ. Erlangen, Wed Jun 9 13:49:46 2004 GMT
 BMBF-Leitprojekt Vernetztes Studium - Chemie