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Möglichkeiten in Substruktursuchen

Die Substruktur ist ein Molekülfragment, sie besitzt also offene Positionen. Dabei können die offenen Positionen beschränkt werden (also nur an bestimmten Stellen sollen sich Substituenten befinden) oder es werden alle denkbaren Substitutionsmuster zugelassen.
Zusätzlich können Atomlisten für eine bestimmte Position definiert oder Eigenschaften für ausgewählte Atome (z.B. nicht-cyclisches Atom) oder Bindungen (z.B. aromatische Bindung) festgelegt werden.
Oft wird durch die Substruktur auch eine bestimmte Substanzklasse selektiert; es können aber auch bestimmte Kohlenstoffgerüste mit beliebigen Substituenten als Suchanfrage gegeben werden.

Substrukturanfrage

Bei diesem Beispiel können sich an den grün markierten Kohlenstoffatomen beliebige Substituenten befinden. Es kann dabei auch ein Ringschluß vorkommen, dieser darf aber nicht zu einem aromatischen System führen (da die violett markierte Doppelbindung keine aromatische Bindung sein soll). Für das rot markierte Atom L wurde eine Atomliste angelegt (es handelt sich um O, N, Cl, Br oder I), daran schließt sich ein einzelnes Atom oder eine Kette an, kein (direkt gebundener) Ring. Aufgrund der C=O-Gruppe und der Atomliste in der Substruktur, wird in diesem Beispiel also nach bestimmten Carbonsäure-Derivaten (Säureamiden, Estern, Säurehalogeniden) gesucht.

Substrukturanfrage

Diese Grafik zeigt einige Beispiele, die bei einer Substrukturrecherche unter Verwendung der vorher beschriebenen Struktureingabe gefunden werden können.

In der folgenden Tabelle sind nochmals einige Beispiele zu Substrukturen zusammengestellt.

Substrukturanfrage

© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. A. Schunk, Dr. Th. Engel, CCC Univ. Erlangen, Wed Jun 9 13:49:45 2004 GMT
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