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Das xyz-Format

Das xyz-Format ist ein sehr einfaches, geordnetes Format und enthält von einer chemischen Struktur nur die Atomtypen und die relativen Koordinaten.

Die Textdatei (ASCII) ist leichtverständlich aufgebaut und enthält in der 1. Zeile die Anzahl der Atome im Molekül. Die 2. Zeile enthält den Namen oder den Titel des Moleküls, kann aber auch leer sein.
Ab der 3. Zeile wird der Aufbau des Moleküls beschrieben, wobei zeilenweise jedes Atom im Molekül behandelt wird: jedes Atom wird durch den Atomtyp und den jeweiligen x-, y- und z- Koordinaten gekennzeichnet.
Im xyz-Format gilt keine strenge Festlegung der Schreibweise für die Zeilen, jedoch muß jedes Feldes durch mindestens ein Freizeichen getrennt sein.

xyz-File von Benzoesäure

Das xyz-File von Benzoesäure

Das xyz-File sollte nur benutzt werden, wenn eine Anwendung keine Angaben zu Bindungen benötigt, z.B. in Animationen, sonst ist das Molfile zu bevorzugen.


© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. Th. Engel, CCC Univ. Erlangen, Wed Apr 7 12:05:55 2004 GMT
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