ViewerLite 5.0

ViewerLite 5.0 von Accelrys (früher Molecular Simulations Inc.) ist kostenlos verfügbar und läuft unter MS-Windows und MacIntoshes. Das ebenfalls erhältliche, kommerzielle Programm-Paket ist ein high-end Visualisierungs-Tool für Molekülmodelle. In der kostenfreien Version können allerdings keine chemischen Strukturen erzeugt werden. Daher unterstützt ViewerLite zur Eingabe 15 unterschiedliche Molekül-Dateiformate wie z.B. csd, mol, mol2, msi, pdb, xyz, etc. und zwölf zum Export (pdb, mol, vrml, etc.). Zusätzlich kann der Viewer automatisch die 3D Geometrie generieren, nachdem eine 2D Struktur von z.B. ISIS/Draw eingefügt worden ist.
Um ein besseres Verständnis der 3D Struktur zu erhalten, können die Modelle rotiert, skaliert, editiert, markiert und vermessen werden. Neben konventionellen Molekülmodell-Visualisierungstypen kann das Programm auch Proteinvisualisierungen darstellen, fehlende Wasserstoffatome hinzufügen und Reste um eine Bindung rotieren. Atom- oder Aminosäure Sequenzen können entsprechend den Elementkonventionen, Ladungen oder Untereinheiten gefärbt werden. Ebenso können Oberflächen generiert und eingefärbt werden. Außerdem sind weitere Features in der kommerziellen Viewer Pro Version erhältlich, insbesondere mehrere Import- und Export-Formate, Anzeige und Berechnungsmöglichkeiten.

Der ViewerLite zeigt Hämoglobin auf der rechten Seite in einer Kombination aus Band- und Kugel-Stab-Modell. Links sind die einzelnen Aminosäuren angegeben

© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. Th. Engel, CCC Univ. Erlangen, Wed Apr 7 12:05:54 2004 GMT
 BMBF-Leitprojekt Vernetztes Studium - Chemie