Van der Waals-Oberfläche

Die van der Waals-Moleküloberfläche kann sehr einfach aus den van der Waals-Radien aller Atome bestimmt werden. Der van der Waals-Radius wiederum, gibt den Abstand an, auf welchen sich nicht gebundenen Atome annähern können. In der dreidimensionalen Darstellung wird dieser Raumbedarf als Kugelsphäre angegeben (Space-Filling-Modell) .

Die Abhängigkeit der van der Waals-Energie von der Distanz zwischen nicht gebundenen Atomkernen. Mit abnehmenden Atomabstand ziehen sich die Kerne an bis die Energie wieder ansteigt. Am Minimum wird der van der Waals-Radius erreicht.

Im Molekül durchdringen sich die Sphären der van der Waals-Radien aller gebundenen Atome. Im nächsten Schritt werden alle Atomsphären verschmolzen.

Schnitt durch das 3D Modell von Ameisensäure. Die van der Waals-Oberfläche wird durch Verbinden aller Atom-Sphären erhalten, die wiederum durch die einzelnen van der Waals-Radien erzeugt werden.

Der Raum innerhalb dieser verschmolzenen Sphären wird als van der Waals-Volumen bezeichnet und die Umhüllende der Sphären definiert die van der Waals-Oberfläche des Moleküls. Diese kann leicht und schnell berechnet werden.

© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. Th. Engel, CCC Univ. Erlangen, Thu Dec 18 14:53:54 2003 GMT
 BMBF-Leitprojekt Vernetztes Studium - Chemie