KOSP

KOSP (Knowledgebase-Oriented Synthesis Planning) ist ein weiteres Programmsystem zur Syntheseplanung aus der Gruppe von K. Funatsu. Es versucht automatisch, ohne Interaktion mit dem Benutzer, mögliche Muster strategischer Bindungen im Zielmolekül zu erkennen. Dies erfolgt mit Hilfe möglichst ähnlicher Reaktionsschemen aus der Reaktionswissensbasis (RKB) von AIPHOS. Innerhalb bestimmter Regeln werden anschließend systematisch verschiedene Kombinationen aller auf diese Weise als strategisch eingestuften Bindungen gebrochen. Die entstehenden Molekülfragmente werden wie in AIPHOS mit Hilfe der Abgangsgruppen-Wissensbasis (LGKB) in mögliche Vorstufen umgewandelt. Alle so abgeleiteten retrosynthetischen Schritte werden wieder anhand der Reaktionswissensbasis (RKB) und der Reaktionsdatenbank (RDB) auf ihre Plausibilität hin überprüft. Damit KOSP entscheiden kann, ob die retrosynthetische Analyse nach einem bestimmten retrosynthetischen Schritt fortgesetzt werden muß oder nicht, wird für die jeweils generierten Vorstufen in der AIPHOS-eigenen Ausgangsmaterialien-Bibliothek nach entsprechenden Ausgangsverbindungen gesucht. Am Ende seiner Analyse schlägt KOSP dem Anwender eine oder mehrere retrosynthetische Strategien für das eingegebene Zielmolekül vor.

Von KOSP vorgeschlagene Synthesestrategie für (S)-7-Amino-5-azaspiro[2.4]heptan

In der Ausgangsmaterialien-Bibliothek von AIPHOS sind strukturelle Merkmale über 10.000 Verbindungen registriert, die aus der ACD-Datenbank ('Available Chemicals Directory' von MDL, ca. 130.000 Verbindungen) gewonnen wurden. Die Bibliothek besitzt eine hierarchische Ordnung abstrakter Graphen, die auf verschiedenen Ebenen strukturelle Merkmale der in der Bibliothek gespeicherten Strukturen erfassen (z.B. nur das Grundgerüst oder das Grundgerüst einschließlich der Positionen funktioneller Gruppen). Über diese Abstraktionsebenen erfolgt der Vergleich mit den aus der retrosynthetischen Analyse gewonnenen Vorstufen.

© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. Th. Engel, M. Sitzmann, CCC Univ. Erlangen, Thu Apr 22 13:31:24 2004 GMT
 BMBF-Leitprojekt Vernetztes Studium - Chemie