Kapitelanfang Vorige Seite Nächste Seite Nächstes Kapitel
VERN Home navigation
 
Chemoinformatik
Einführung in die Chemoinformatik
Repräsentation chemischer Strukturen
Einleitung
Nomenklatur
Linearnotation
Konstitutionscodierung
3D-Codierung
Einführung
Geordnete Listen
  Rotationslisten
Permuationslisten
Zuordnung-Tetraeder
Rotation-Tetraeder
Spiegelung-Tetraeder
Zuordnung-Doppelbindung
cis-Deskriptor
trans-Deskriptor
Stereochemie im Molfile I
Stereochemie im Molfile II
SMILES
Koordinatensysteme
Kartesisches Koordinatensystem
Internes Koordinatensystem
Z-Matrix
Oberflächen
Literatur
Repräsentation chemischer Reaktionen
Daten/Datenformate
Datenbanken/Datenquellen
Struktur-Suchmethoden
Berechnung physikalischer und chemischer Daten
Deskriptoren für chemische Verbindungen
Methoden zur Datenanalyse
Anwendungen

Startseite

Rotationslisten

Die Beschreibung der Stereochemie durch Rotationslisten wurde 1990 von Cook und Rohde für das Standard Molecular Data- (SMD-) Format eingeführt. Hierbei werden grundlegende geometrische Anordnungen von Atomen (z.B. tetraedrisch, oktaedrisch, etc.) um ein Stereozentrum in einer Liste vordefiniert. Zusätzlich werden auch die Atome in diesen Stereoelementen mit Zahlen in einer vordefinierten Weise gekennzeichnet.

Geometrischen Anordnungen

Eine Auswahl an stereochemischen Anordnungen die in einer Rotationsliste beschrieben werden können

Jede stereochemische Struktur kann somit durch die Angabe des Stereoelements und der dazugehörenden Atomnummerierung, der sogenannten Rotationsliste beschrieben und erkannt werden. Diese Angaben sind z.B. im "STEREO"-Block des SMD-Formats abgelegt. Die kompakte und erweiterbare Darstellung der Rotationslisten kann zusätzlich Information enthalten, wie z.B. Spezifikation der Geometrie, oder ob eine Konfiguration absolut, relativ oder racemisch ist.

Stereo-Block Rotationsliste

Die Rotationsliste eines tetraedrischen Kohlenstoffatoms im "STEREO"-Block (rechts), eingebunden in der Bindungsliste eines SMD-Files


© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. Th. Engel, CCC Univ. Erlangen, Thu Dec 18 14:53:54 2003 GMT
navigation BMBF-Leitprojekt Vernetztes Studium - Chemie