Eigenschaften von Strukturdeskriptoren
Die Tabelle faßt die wichtigsten Invarianz-Eigenschaften verschiedener Strukturdeskriptoren zusammen.
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Deskriptor
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Molekülrepräsentation
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Mathematische Repräsentation
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Invariante Eigenschaften
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| Molekulargewicht |
0D
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Skalar
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ncd
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| Atomtyp Zähler |
0D
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Skalar
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ncd
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| Fragment-Zähler |
1D
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Skalar
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ncd
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| Topologische Informationsindices |
2D
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Skalar
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ncd
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| Molekülprofile |
2D
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Vektor
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ncd
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| Substituenten-Konstanten |
3D
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Skalar
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ncd/lcd
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| WHIM Deskriptoren |
3D
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Vektor
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hcd
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| 3D-MoRSE Deskriptoren |
3D
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Vektor
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ncd/icd
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| Oberfläche/Volumen Deskriptoren |
3D
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Skalar
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hcd/icd
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| Quanten-chemische Deskriptoren |
3D
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Skalar
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icd/hcd
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| Wechselwirkungs-Energiewerte |
4D
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Gitter
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hcd
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Invariante Eigenschaften verschiedener Deskriptoren (ncd: no conformational dependency = keine Abhängigkeit der Konformation; lcd: low conformational dependency = geringe Abhängigkeit der Konformation; icd: intermediate conformational dependency = mittlere Abhängigkeit der Konformation; hcd - high conformational dependency = hohe Abhängigkeit der Konformation)
Topologische und 3D-Deskriptoren, die im "Distanz-Raum" berechnet wurden, wie z.B. 3D Autokorrelation, Oberflächen-Autokorrelation und RDF sind Translations- und Rotations-Invariant. Trotzdem können alle diese Deskriptoren nicht zur Unterscheidung von Enantiomeren herangezogen werden.
Zur Berechnung Gitter-basierter Deskriptoren müssen in einem ersten Schritt die Liganden angeordnet (aligned) werden. Haben die Moleküle das gleiche Skelett, ist das Alignment unkritisch.
© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. Th. Engel, CCC Univ.
Erlangen, Wed Jun 9 12:55:24 2004 GMT
 BMBF-Leitprojekt
Vernetztes Studium - Chemie
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