Literatur und Zusatzinformation
Allgemeine Literatur
- R. Todeschini, V. Consonni, "Handbook of Molecular Descriptors", in "Methods and Principles in Medicinal Chemistry", Vol. 11, R. Mannhold, H. Kubinyi, H. Timmerman (Eds.), Wiley-VCH, Weinheim, 2000.
- "Handbook of Chemoinformatics", J. Gasteiger (Ed.), Wiley-VCH, Weinheim, 2003, Chapter VII.
Spezielle Literatur
- G. Moreau, P. Broto, Nouv. J. Chim. 1980, 4, 359-360
- H. Wiener, J. Am. Chem. Soc. 1947, 69, 17-20
- M. Randic, J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 6609-6615
- M. Rarey, J. S. Dixon, J. Comput.-Aided Mol. Design 1998, 12, 471-490
- P. Debye, Phys. Zeitschr. 1927, 31,135-141
- R. Wierl, Ann. Phys. (Leipzig) 1931, 8, 521-564
- L.J. Soltzberg, C.L. Willins, J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 439-443
- J.H. Schuur, P. Selzer, J. Gasteiger, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1996, 36, 334-344
- J. Gasteiger, J. Sadowski, J. Schuur, P. Selzer, L. Steinhauer, V. Steinhauer, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1996, 36, 1030-1037
- V. Steinhauer, J. Gasteiger, Obtaining the 3D structure from infrared spectra of organic compounds using neural networks, in Software-Entwicklung in der Chemie 11, G. Fels, V. Schubert (eds.), Gesellschaft Deutscher Chemiker, Frankfurt/Main, 1997
- J. Karle, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1994, 34, 381-390
- J. Gasteiger, J. Schuur, P. Selzer, L. Steinhauer, V. Steinhauer, Fresenius J. Anal. Chem. 1997, 359, 50-55
- M.C. Hemmer, V. Steinhauer, J. Gasteiger, Vib. Spectrosc. 1999, 19, 151-164
- P.G. Mezey, Molecular Surface in K. B. Lipkowitz, D. B. Boyd, Eds. Reviews in Computational Chemistry, VCH, New York, NY, 1990, Vol. 2, 265-294
- M. Karelson, V. S. Lobanov, A. R. Katritzky, Chem. Rev. 1996, 96, 1027-1043.
- A. M. Ferguson, T. W. Heritage, P. Jonathon, S. E. Pack, L. Phillips, J. Rogan, P. J. Snaith J. Comput.-Aided Mol. Design 1997, 11, 143-152
- D. B. Turner, P. Willett, A. M. Ferguson, T. W. Heritage, J. Comput.-Aided Mol. Design 1997, 11, 409-422
- R.D. Cramer III, D.E. Patterson, J.D. Bunce, J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 5959-5967
- F.R. Burden, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1989, 29, 225-228
- A.J. Hopfinger, S. Wang, J.S. Tokarski, B. Jin, M. Albuquerque, P.J. Madhav, C. Duraiswami, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 10509-10524
- A.J. Hopfinger, A. Reaka, P. Venkatarangan, J.S. Duca, S. Wang, J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1999, 39, 1151-1160
- A.J. Hopfinger, J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 7197-7206
- A.J. Hopfinger, J. Med. Chem. 1981, 24, 818-822
- O.A. Raevsky, V.Y. Grigor'ev, D.B. Kireev, N.S. Zefirov, Quant. Struct.-Act. Relat. 1992, 11, 49-63
- O.A. Raevsky, V.Y. Grigor'ev, D.B. Kireev, N.S. Zefirov, J. Chim. Phys. 1992, 89, 1747-1753
- O.A. Raevsky, Hydrogen Bond Strength Estimation by means of HYBOT. In H. van de Waterbeemd, B. Testa, G. Folkers, Eds., Computer-Assisted Lead Finding and Optimization, Wiley-VCH, Weinheim, 1997, pp. 367-378
Interessante Websites und Software
- ADAPT (QSAR-Programm mit Deskriptorberechnungen, Variablenselektion und Modelling); P.C. Jurs, PennState University, University Park, PA 16802, USA: http://research.chem.psu.edu/pcjgroup/ADAPT.html
- ASP (quantitative Ähnlichkeitsberechnungen aufgrund "Molecular Shape", elektrostatisches Potential und lipophilen Eigenschaften; Teil der TSAR3D Suite); Accelrys Inc.: http://www.accelrys.com/products/tsar/asp.html
- AUTOCORR; Molecular Networks GmbH, Nägelsbachstrasse 25, D-91052 Erlangen, Germany: http://www.mol-net.de/
- CODESSA (Berechnung verschiedener Deskriptoren inkl. quantenchemischer Deskriptoren); Semichem Inc. - 7204 Mullen, Shawnee, KS 66216, USA: http://www.semichem.com
- CONCORD; TRIPOS, Inc., 1699 South Hanley Road, St. Louis, MO 63144, USA: http://www.tripos.com
- CORINA (3D Strukturgenerator); J. Gasteiger, Computer-Chemie-Centrum, University Erlangen-Nürnberg, Nägelsbachstrasse 25, D-91052 Erlangen, Germany: http://www2.chemie.uni-erlangen.de/
- DRAGON (Berechnung einer großen Anzahl an Deskriptoren - topologische, geometrische, WHIM, 3D-MoRSE Deskriptor, molekulare Profile, etc.); R. Todeschini, erhältlich bei Talete srl, via Pisani 13, 20124 Milano, Italien: http://www.disat.unimib.it/chm
- GALAXY; AM Technologies, 14785 Omicron Drive, Texas Research Park, San Antonio, TX 78245, USA: http://www.am-tech.com
- GRID (Berechnung eines GRID empirischen Kraftfelds an Gitterpunkten); Peter Goodford, Molecular Discovery Ltd., West Way House, Elms Parade, Oxford OX2 9LL, UK: http://www.moldiscovery.com/
- HASL: http://www.eslc.vabiotech.com/hasl/ or http://www.edusoft-lc.com
- HINT: http://www.eslc.vabiotech.com/hint
- HYBOT-Plus (Thermodynamik von Wasserstoffbrückenbindungen, Berechnung lokaler und molekularer physikochemischer Deskriptoren): http://www.timtec.net/software/hybot-plus.htm
- JOELib: http://joelib.sourceforge.net
- MOE; Chemical Computing Group Inc.: http://www.chemcomp.com
- Molconn-Z: http://www.eslc.vabiotech.com/molconn/manuals/310s/preface1.html
- Molinspiration (Berechnung von log P (Fragment-basierte Methode + Korrektur Faktoren), molekulare polare Oberflächen TPSA (Ertl), "Rule of 5" (Lipinski), Anzahl an rotierbaren Bindungen, Drug-likeness Index): http://www.molinspiration.com
- PENGUINS; Molecular Discovery Ltd., West Way House, Elms Parade, Oxford OX2 9LL, UK: http://www.moldiscovery.com/
- PETRA (Berechnung von physikochemischen Parametern); Molecular Networks GmbH, Nägelsbachstrasse 25, D-91052 Erlangen, Germany: http://www.mol-net.de/
- VolSurf; Molecular Discovery Ltd., West Way House, Elms Parade, Oxford OX2 9LL, UK: http://www.moldiscovery.com/
Weitere Information über Software zum Computer-unterstützten Drug Design (CADD) ist unter dieser Website erhältlich: http://www.netsci.org/Resources/Software/Modeling/CADD/.
© Prof. Dr. J. Gasteiger, Dr. Th. Engel, CCC Univ. Erlangen, Wed Jun 9 12:55:24 2004 GMT
BMBF-Leitprojekt Vernetztes Studium - Chemie
|